Το παιχνίδι ακολουθεί το Shadow the Hedgehog , μια δημιουργία τουπαππού του γιατρού Eggman , του καθηγητή Gerald Robotnik , καθώς προσπαθεί να μάθει για το παρελθόν του ενώ έπασχε από αμνησία . Όπως τα προηγούμενα παιχνίδια της σειράς Sonic , το βασικό παιχνίδι περιλαμβάνει γρήγορο τρέξιμο, συλλογή δαχτυλιδιών και καταστροφή εχθρών. Τα νέα χαρακτηριστικά παιχνιδιού ξεχωρίζουν το Shadow the Hedgehog από τα προηγούμενα παιχνίδια Sonic . Mπορεί να χρησιμοποιήσει όπλα για να πολεμήσει τους εχθρούς, προσθέτοντας ένα στοιχείο του παιχνιδιού shooter τρίτου προσώπου. Μέρη του τοπίου, όπως τα σήματα κυκλοφορίας , μπορούν επίσης να χρησιμοποιηθούν ως όπλα. Iκανότητα οδήγησης οχημάτων, όπως μοτοσικλετών και εξωγήινων αεροσκαφών.